LCBaSe 3.0 - en forskningsdatabas för epidemiologisk lungcancerforskning

LCBaSe 3.0 skapades 2023 för att optimera förutsättningarna för klinisk epidemiologisk lungcancerforskning baserad på information i Nationella Lungcancerregistret.

Databasen innehåller kvalitetsregisterdata länkade till hälso- och sjukvårdsregister vid Socialstyrelsen och demografiska databaser vid Statistiska Centralbyrån.

LCBaSe 3.0 bedrivs som ett forskningsprojekt med Region Uppsala som huvudman och centralt personuppgiftsansvarig (CPUA).

LCBaSe 3.0 innehåller information från:

  • Nationella lungcancerregistret
  • Registret över Totalbefolkningen (SCB)
  • Dödsorsaksregistret (SoS)
  • Cancerregistret (SoS)
  • Patientregistret (SoS)
  • Läkemedelsregistret (SoS)
  • Flergenerationsregistret (SCB)
  • Longitudinell integrationsdatabas för sjukförsäkrings- och arbetsmarknads-studier (LISA) (SCB)
  • Intensivvårdsregistret
  • SMINET (Folkhälsomyndigheten)
  • Svenskt Perioperativt Register (SPOR)

LCBaSe 3.0 har nationell täckning och innehåller även två kontrollpopulationer för fall-kontroll- respektive kohortstudier. Totalt omfattar LCBaSe över 80 000 individer med en lungcancerdiagnos mellan 1995 och 2022.

Kontrollerna är individer utan lungcancer vid tidpunkten för fallets diagnos, identifierade i Registret för Totalbefolkningen och matchade på kön, födelseår och hemortslän vid diagnos. Kontrollserien för fall-kontroll studier består av fem slumpmässigt valda kontroller per indexfall valda med återläggning, och kontrollserien för kohortstudier av fem slumpmässigt valda kontroller per indexfall valda utan återläggning (unika individer).

LCBaSe 3.0 hålls på en server speciellt tillägnad forskningsdata på RCC Mellansverige. En RCC-knuten statistiker skapar i dialog med aktuell forskare och projektstatistiker en studiefil som analyseras antingen lokalt (statistiker på RCC) eller av forskaren/ projektstatistiker via distansåtkomst på en forskningsportal. På forskningssportalen finns mjukvara för statistisk analys tillgänglig (SPSS, STATA, R, SAS). Via forskningsportalen ges forskaren tidsbegränsad åtkomst till studiefilen med loggning av datatrafiken. Studiefilen sparas på servern under 10 år efter publikation för att kunna tillhandahållas forskaren vid krav på kompletterande analys.

Så gör du för att använda LCBaSe 3.0 för forskning

  1. Ansökan om tillgång till data från LCBaSe 3.0 görs på uttagsblankett som tillsammans med kortfattad studieplan skickas till anna.pedersen@lihme.se.  
  2. Ansökningar behandlas löpande av styrgruppen för Nationella lungcancerregistret. Bedömning görs om aktuell frågeställning redan belysts eller är under analys av annan forskargrupp. Svar erhålls som regel inom fyra veckor efter att ansökan inkommit.
  3. Godkännande av ansökan görs av styrgruppen för Nationella lungcancerregistret.
  4. När du har fått godkännande ingås ett PUB-avtal mellan RCC Mellansverige och den region forskaren tillhör. Om frågeställning inte faller inom befintligt etiktillstånd för LCBaSe behöver tilläggsansökan lämnas in.
  5. Studiefil tas fram av ansvarig RCC Mellansverige statistiker och levereras till forskaren eller görs tillgänglig via forskningsportalen

Variabellista

Variabler som finns i forskningsdatabasen listas i länkad variabellista (se nedan). Variabellistan ska bifogas din ansökan (de flikar som inte är relevanta för ansökan raderas)

Variabellista

Forskningspublikationer baserade på LCBaSe 1. 0, 2.0 och 3.0

  1. Berglund A, Holmberg L, Tishelman C, Wagenius G, Eaker S, Lambe M.: Social inequalities in non-small cell lung cancer management and survival: a population-based study in central Sweden. Thorax. 2010 Apr;65(4):327-33
  2. Myrdal G, Lamberg K, Lambe M, Ståhle E, Wagenius G, Holmberg L.: Regional differences in treatment and outcome in non-small cell lung cancer: a population-based study (Sweden). Lung Cancer. 2009 Jan;63(1):16-22.
  3. Nilsson J, Berglund.A, Bergström S, Bergqvist M, Lambe M: The role of comorbidity in the ma-nagement and prognosis in nonsmall cell lung cancer: a population-based study. Acta Oncol.2017 Jul;56(7):949-956
  4. Löfling L, Karimi A, Sandin F, Bahmanyar S, Kieler H, Lambe M, Lamberg K, Wagenius G.: Clinical characteristics and survival in non-small cell lung cancer patients by smoking history: a population-based-cohort stud. Acta Oncol. 2019 Nov;58(11):1618-1627.
  5. Tendler S, Holmqvist M, Wagenius G, Lewensohn R, Lambe M, De Petris L. Educational level, management and outcomes in small-cell lung cancer (SCLC): A population-based cohort study. Lung Cancer. 2020 Jan;139:111-117.
  6. Radkiewicz C, Dickman PW, Johansson ALV, et al.: Sex and survival in non-small cell lung cancer: A nationwide cohort study. PLoS One. 2019 Jun 27;14(6).
  7. Willén L, Berglund A, Bergström S, et al.: Educational level and management and outcomes in non-small cell lung cancer. A nationwide population-based study. Lung Cancer. 2019 May;131:40- 46.
  8. Löfling L, Bahmanyar S, Kieler H, Lambe M, Wagenius G.: Antibiotic use prior to a lung cancer diagnosis: a population-based study. Cancer Causes Control. 2021 Jun;32(6):597-607.
  9. Willén L, Berglund A, Bergström S, Isaksson J, Bergqvist M, Wagenius G, Lambe M.: Are older patients with non-small cell lung cancer receiving optimal care? A population-based study. Acta Oncol. 2022 Mar;61(3):309-317.
  10. Löfling L, Bahmanyar S, Kieler H, Lambe M, Wagenius G.: Temporal trends in lung cancer survi- val: a population-based study. Acta Oncol. 2022 May;61(5):625-631.
  11. Willén L, Berglund A, Bergström S, Isaksson J, Bergqvist M, Wagenius G, Lambe M.: Patterns of care and outcomes in immigrants with non-small cell lung cancer. A population-based study (Sweden). PLoS One. 2022 Dec 15;17(12).